Uravnotežena crevna mikroflora osnova je jakog imuniteta, otpornosti na bakterije i viruse, kao i pravilnog metabolizma. Do narušavanja dobrih crevnih bakterija dolazi usled dugotrajne upotrebe antibiotika, nepravilne ishrane, te visokog unosa ugljenih hidrata i prostih šećera. Probiotici se preporučuju kod putničke i virusne dijareje, kod dugotrajne terapije antibioticima, kod nadutosti, mučnine i gasova.